Une Macro est disponible pour l'extraction des paramètres O-I1-I2-P/OJIP
La macro, écrite par le Dr. Katharina Siebke, peut extraire un ensemble de paramètres sélectionnés, décrivant physiquement la montée polyphasique. Dans le fichier pdf associé, la macro et les paramètres sont décrits, et quelques exemples d’application sont donnés.
Une mesure d’induction de fluorescence d’une durée de 320 ms avec une résolution temporelle de 10 µs équivaut à 32000 points : c’est la raison pour laquelle il faut un outil permettant d’analyser de telles mesures, si riches en points de mesure.
Katharina Siebke a créé un tel outil - une macro Excel - avec lequel un ensemble de paramètres qui décrivent physiquement les cinétiques O-I1-I2-P ou OJIP peuvent être extraits à partir de ces inflexions.
Comme certains de ces paramètres n’ont pas été explorés dans la littérature, nous ne savons pas si tous ces paramètres sont intéressants d’un point de vue physiologique. Cependant, l’utilisateur pourra sans doute le découvrir par lui-même.
Exemple d’analyse
Le premier auteur a consacré une grande partie de sa vie professionnelle à comprendre les inflexions O-I1-I2-P dans un sens physiologique. En mesurant le signal 820 nm ou P700 en parallèle, il n’est pas si difficile de montrer que l’augmentation de O à P reflète la réduction de l’ensemble de la chaîne de transport d’électrons, de l’QA à la ferrédoxine-NADP + réductase. Déjà en 1989, Schreiber et ses collègues ont montré que l’augmentation de I2-P est parallèle à la réduction de P700+ dans les feuilles adaptées à l’obscurité. Ce que cela signifie reste un sujet de discussion jusqu’à aujourd’hui (par exemple, Schreiber et Klughammer 2021, Pfündel 2021). Les étapes de l’augmentation de la fluorescence nous donnent des informations non seulement sur le processus de réduction, mais aussi sur la stoechiométrie des composants de la chaîne de transport des électrons (taille du pool PQ, taille du pool Fd). Joliot et Joliot (2002) ont divisé la zone au-dessus de l’augmentation de la fluorescence entre O et P d’une feuille d’épinard de manière cinétique en une partie de pool PQ et une partie Fd qui, dans leurs échantillons, représentaient des tailles de pool approximativement égales. L’augmentation polyphasique peut, surtout en combinaison avec les mesures de P700, être utilisée très efficacement pour détecter des lésions spécifiques dans la chaîne de transport des électrons photosynthétiques.
Pour les analyses Sigma (pour déterminer la section efficace de l’antenne de la PS II), une forte impulsion de lumière est combinée avec un seul flash. De telles mesures montrent que tout “QA réduit” équivaut à l’étape I1 saturée. Ceci avait déjà été démontré par Schreiber (1986) et peut être démontré de façon routinière avec des instruments modernes. Le(s) processus qui détermine(nt) l’augmentation de la fluorescence de I1 à P reste(nt), 55 ans et plus après les articles de Morin (1964) et Delosme (1967) et l’introduction du terme phase thermique, un sujet de discussion. Il est cependant clair qu’un modèle QA pur ne peut pas expliquer l’augmentation de la fluorescence et que, par conséquent, les modèles d’analyse basés sur un modèle d’QA pur, comme le test JIP, ne peuvent pas fonctionner. Ce que nous pensons nécessaire, c’est de prendre des points et des caractéristiques de l’augmentation polyphasique qui ont été caractérisés expérimentalement dans la littérature. Une telle caractéristique du JIP-test est le calcul de la pente initiale par rapport à l’étape I1 ou J. Dans la partie principale du texte, les points et les caractéristiques que la Macro a tirés de la montée O-I1-I2-P seront discutés.
Dépendance par rapport l’intensité de lumière à différentes longueurs d’ondes