La protéomique étudie les protéines des cellules. Cette analyse se fait en plusieurs étapes : les protéines à étudier sont d'abord extraites des cellules, puis séparées selon leurs caractéristiques physiques et chimiques. Les protéines obtenues sont alors identifiées afin d'obtenir une image des protéines présentes dans les cellules à un moment donné, dans des conditions données.
La protéomique utilise des techniques scientifiques récentes, comme l'électrophorèse ou la chromatographie pour la séparation des protéines. Leur identification est ensuite effectuée grâce à des spectromètres de masse, matériels lourds et très coûteux, dont la disponibilité est encore réduite.
La protéomique permet de localiser les différentes protéines présentes dans les cellules afin d'analyser les réactions de modification qu'elles subissent et leur mode d'interactions avec les autres protéines.
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