Synthèse d’oligonucléotides ADN/ARN traçables pour R&D et IVD

Problématique / Besoin :

Des équipes R&D, IVD et précliniques doivent disposer d’oligonucléotides ADN/ARN hautement reproductibles, traçables et strictement adaptés à l’usage (recherche, diagnostic, in vivo). En diagnostic, des variations de pureté, d’intégrité de séquence et de marquage (sondes dual-labeled, double-quenched, MGB, LNA, molecular beacons) dégradent le rapport signal/bruit, la Tm, la sensibilité et la discrimination des mismatches, ce qui fragilise la robustesse des kits, complique le multiplex et met en risque la continuité d’approvisionnement. Les besoins couvrent des longueurs et usages hétérogènes (6–150 nt en research, 6–50 nt en diagnostic, 10–27 nt en therapeutic) avec des exigences de modifications élevées (>250 modifications possibles) et, pour certains lots in vivo, des contraintes « low endotox ». Le tout doit s’inscrire dans un cadre réglementaire et qualité démontrable (ISO 9001:2015 et unité de synthèse EN ISO 13485:2016), avec qualification/validation continue via tests d’aptitude, afin de sécuriser la conformité et la reproductibilité inter-lots.

Méthode utilisée / Réponse apportée :

Mise en place d’une prestation intégrée couvrant conception, synthèse et analyses ADN/ARN, combinant plateformes de synthèse haut débit, procédés propriétaires et intervention de chimistes de procédés avec gestion de projet dédiée. Ajustement de la stratégie analytique et de purification selon l’usage: désalage, RP-HPLC, IEX-HPLC, HPLC + dialyse ou PAGE. Contrôle qualité renforcé par MS (MALDI-TOF ou ESI selon cas) et HPLC analytique pour répondre aux exigences diagnostic/therapeutic, avec délivrance d’une documentation de lot (fiche technique/CoA) et options « low endotox » pour l’in vivo. Développement qPCR/dPCR avec réglage chiffré des paramètres critiques (signal/bruit, Tm, sensibilité, discrimination des mismatches) et support IVD sur le cycle complet (faisabilité, design/validation, vérification, commercialisation, retour terrain), incluant appui à l’isolement ADN/ARN et au développement d’essais. Capacité opérationnelle structurée pour sécuriser délais et volumes: >130 experts répartis en Suisse, Allemagne, Autriche et France, environ 2 850 m² de laboratoires et un site en France; production couvrant 13–40 nt avec des délais indicatifs de 3 à 5 jours ouvrés selon la chimie, et des quantités allant jusqu’à plusieurs centaines de mg en therapeutic, avec options de conjugaison (GalNAc, cholestérol, palmitate) et conditionnements adaptés au screening et aux études in vivo.