Validation rapide et économique de plasmides avec Full PlasmidSeq

Antion Biosciences, confrontée à la nécessité de séquencer intégralement des plasmides de plus de 10 kb, a rencontré des défis liés aux coûts élevés et au temps requis par les méthodes traditionnelles. Le service Full PlasmidSeq de Microsynth a permis de surmonter ces obstacles en offrant une solution rapide et économique, réduisant significativement les besoins en ADN et éliminant l'utilisation d'amorces multiples.

Problématique

Antion Biosciences, une entreprise spécialisée dans le développement de thérapies géniques, devait séquencer intégralement des plasmides souvent supérieurs à 10 kilobases (kb). Les méthodes traditionnelles de séquençage Sanger nécessitaient l'envoi de multiples amorces pour chaque plasmide, entraînant :

• Des coûts élevés en consommables.
• Une consommation importante d'ADN.
• Des délais prolongés pour obtenir les résultats.

Ces contraintes ralentissaient le processus de validation des plasmides, impactant le développement rapide de leurs produits.

Solution

Pour répondre à ces défis, Antion Biosciences a adopté le service Full PlasmidSeq de Microsynth, basé sur la technologie de séquençage à longues lectures d'Oxford Nanopore. Cette solution présente plusieurs avantages :

• Réduction de la quantité d'ADN requise : Seuls 300 ng d'ADN sont nécessaires pour séquencer un plasmide complet, contre des quantités plus élevées avec les méthodes traditionnelles.
• Élimination des amorces multiples : Le séquençage sans hypothèse préalable supprime le besoin d'amorces spécifiques, simplifiant la préparation des échantillons.
• Rapidité des résultats : Les séquences complètes des plasmides sont disponibles en ligne 1 à 3 jours après l'envoi des échantillons, accélérant le processus de validation.
• Réduction des coûts : La diminution des consommables et du temps de manipulation entraîne une baisse significative des dépenses associées au séquençage.

Grâce à Full PlasmidSeq, Antion Biosciences a optimisé son flux de travail, permettant une validation plus rapide et économique de ses plasmides, tout en maintenant une haute qualité de séquençage.