Dépistage des erreurs de séquençage dans des plasmides Addgene

Les chercheurs utilisant des plasmides provenant de sources partagées, telles qu'Addgene, rencontrent fréquemment des dysfonctionnements expérimentaux dus à des erreurs de séquence. Le service Full PlasmidSeq de MICROSYNTH FRANCE SAS, basé sur la technologie Oxford Nanopore, offre une solution efficace pour identifier et corriger ces anomalies, garantissant ainsi la fiabilité des expériences en biologie moléculaire.

Problématique

Les laboratoires de recherche en biologie moléculaire utilisent couramment des plasmides issus de banques partagées, notamment ceux fournis par Addgene. Cependant, il arrive que ces plasmides ne fonctionnent pas comme prévu, entraînant des résultats expérimentaux erronés. Ces dysfonctionnements sont souvent dus à des erreurs de séquence non détectées dans les cartes des plasmides, pouvant causer des échecs lors des procédures de clonage. Les conséquences incluent :

• Perte de temps significative pour identifier la source des problèmes.
• Coûts supplémentaires liés à la répétition des expériences.
• Risques de publier des données inexactes, compromettant la crédibilité scientifique.

Solution apportée par MICROSYNTH FRANCE SAS

Pour remédier à ces défis, MICROSYNTH FRANCE SAS propose le service Full PlasmidSeq, basé sur la technologie de séquençage à longues lectures d'Oxford Nanopore. Cette solution permet :

• Séquençage intégral des plasmides : Obtention de la séquence intégrale du plasmide sans nécessité d'amorces spécifiques, facilitant la détection des erreurs de séquence.
• Rapidité : Résultats disponibles en 1 à 2 jours ouvrés après réception des échantillons, accélérant le processus de validation des plasmides.
• Économie : Réduction des coûts en éliminant la préparation laborieuse des plasmides et en diminuant le besoin de répéter les expériences.
• Analyse bioinformatique complète : Fourniture d'une séquence consensus annotée, de cartes plasmidiques interactives et de rapports détaillés sur la qualité du séquençage, permettant une interprétation aisée des résultats.

En adoptant le service Full PlasmidSeq de MICROSYNTH FRANCE SAS, les chercheurs peuvent assurer l'intégrité de leurs plasmides, minimiser les erreurs expérimentales et optimiser l'efficacité de leurs projets en biologie moléculaire.