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Analyse Métagénomique Shotgun du Microbiote par Séquençage de Nouvelle Génération

Analyse Métagénomique du Microbiote par Séquençage de Nouvelle Génération

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Description

Considérations avant de lancer un projet de métagénomique shotgun :

  • Quantités d'échantillons et origine ?
  • Profondeur de séquençage (sensibilité) ?
  • Focus sur le potentiel génétique ou sur la taxonomie ?
  • Complexité et composition de la communauté ?
  • Étude descriptive et/ou empirique ?

Laissez-nous vous guider - de la conception à l'analyse

 

Exemples de projets utilisant la métagénomique shotgun :

  • Analyse des communautés microbiennes
  • Changement des communautés et du potentiel génomique en fonction de l'évolution des conditions environnementales
  • Adaptations évolutives dans les micro-environnements
  • Analyse au niveau des gènes des communautés microbiennes non cultivables
  • Détection de virus dans les tissus et les exsudats de mammifères

Applications liées à la métagénomique shotgun :

  • Métagénomique des amplicons
  • Métatranscriptomique shotgun
  • Reséquençage des bactéries
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